MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Allochromatium vinosum DSM 180 chromosome

Total Repeats: 6289

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_013851	AGGC	2	8	1924611	1924618	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3502	NC_013851	CGGCG	2	10	1924640	1924649	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
3503	NC_013851	CGGAC	2	10	1925263	1925272	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
3504	NC_013851	A	6	6	1925288	1925293	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3505	NC_013851	CGATC	2	10	1925358	1925367	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
3506	NC_013851	CGA	2	6	1925372	1925377	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3507	NC_013851	GAC	2	6	1925378	1925383	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3508	NC_013851	CGCGC	2	10	1925688	1925697	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
3509	NC_013851	CGA	2	6	1925700	1925705	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3510	NC_013851	CAGC	2	8	1926568	1926575	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
3511	NC_013851	CGGT	2	8	1928430	1928437	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
3512	NC_013851	CGGC	2	8	1929877	1929884	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3513	NC_013851	TGC	2	6	1929949	1929954	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3514	NC_013851	AGC	2	6	1929957	1929962	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3515	NC_013851	GGC	2	6	1930033	1930038	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3516	NC_013851	GCC	2	6	1930043	1930048	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3517	NC_013851	CAC	2	6	1930123	1930128	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3518	NC_013851	GGT	2	6	1930740	1930745	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3519	NC_013851	CCG	2	6	1930762	1930767	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3520	NC_013851	GGATG	2	10	1932002	1932011	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
3521	NC_013851	TGA	2	6	1932026	1932031	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3522	NC_013851	GGT	2	6	1932105	1932110	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3523	NC_013851	TAA	2	6	1932123	1932128	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3524	NC_013851	GCCG	2	8	1942012	1942019	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3525	NC_013851	GCC	2	6	1942042	1942047	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3526	NC_013851	GGC	2	6	1942129	1942134	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3527	NC_013851	CGG	2	6	1942181	1942186	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3528	NC_013851	GCCGA	2	10	1942235	1942244	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
3529	NC_013851	T	6	6	1942285	1942290	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3530	NC_013851	GTG	2	6	1942293	1942298	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3531	NC_013851	GGC	2	6	1945667	1945672	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3532	NC_013851	AGC	2	6	1945679	1945684	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3533	NC_013851	GATC	2	8	1945685	1945692	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3534	NC_013851	TGA	2	6	1946353	1946358	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3535	NC_013851	CGATC	2	10	1946373	1946382	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
3536	NC_013851	TGGC	2	8	1946388	1946395	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
3537	NC_013851	ATTT	2	8	1946447	1946454	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3538	NC_013851	TGG	2	6	1946484	1946489	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3539	NC_013851	CACGGC	2	12	1946605	1946616	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
3540	NC_013851	GAG	2	6	1946645	1946650	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3541	NC_013851	CAA	2	6	1949777	1949782	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3542	NC_013851	CAGC	2	8	1949786	1949793	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
3543	NC_013851	AGCG	2	8	1949817	1949824	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3544	NC_013851	GAC	2	6	1949830	1949835	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3545	NC_013851	CGG	2	6	1951917	1951922	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3546	NC_013851	TAAAA	2	10	1951963	1951972	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
3547	NC_013851	TTA	2	6	1951985	1951990	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3548	NC_013851	CGG	2	6	1952027	1952032	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3549	NC_013851	CATC	2	8	1952965	1952972	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
3550	NC_013851	CTG	2	6	1953343	1953348	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3551	NC_013851	CTG	2	6	1953375	1953380	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3552	NC_013851	CCG	2	6	1953429	1953434	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3553	NC_013851	AGG	2	6	1953465	1953470	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3554	NC_013851	GCACG	2	10	1953499	1953508	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
3555	NC_013851	GC	3	6	1953546	1953551	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3556	NC_013851	GCGG	2	8	1953722	1953729	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
3557	NC_013851	ATC	2	6	1953766	1953771	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3558	NC_013851	GCG	2	6	1953856	1953861	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3559	NC_013851	CG	3	6	1953872	1953877	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3560	NC_013851	CGGA	2	8	1953960	1953967	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3561	NC_013851	CGA	2	6	1953975	1953980	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3562	NC_013851	CTG	2	6	1953982	1953987	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3563	NC_013851	GC	3	6	1954062	1954067	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3564	NC_013851	GTG	2	6	1954115	1954120	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3565	NC_013851	GCC	2	6	1955399	1955404	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3566	NC_013851	AC	3	6	1955919	1955924	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3567	NC_013851	CCG	2	6	1956339	1956344	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3568	NC_013851	AG	4	8	1956922	1956929	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3569	NC_013851	GAA	2	6	1956998	1957003	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3570	NC_013851	GAC	2	6	1957071	1957076	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3571	NC_013851	CGT	2	6	1957096	1957101	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3572	NC_013851	AGC	2	6	1957113	1957118	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3573	NC_013851	GTCC	2	8	1957132	1957139	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
3574	NC_013851	ACG	2	6	1957158	1957163	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3575	NC_013851	GC	3	6	1957206	1957211	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3576	NC_013851	TCC	2	6	1957225	1957230	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3577	NC_013851	CGGT	2	8	1957244	1957251	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
3578	NC_013851	TCA	2	6	1957255	1957260	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3579	NC_013851	CTG	2	6	1960948	1960953	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3580	NC_013851	GTCTG	2	10	1961038	1961047	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
3581	NC_013851	ACC	2	6	1961115	1961120	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3582	NC_013851	CGC	2	6	1961197	1961202	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3583	NC_013851	CGA	2	6	1963415	1963420	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3584	NC_013851	TCGA	2	8	1963465	1963472	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3585	NC_013851	CCG	2	6	1963519	1963524	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3586	NC_013851	GCG	2	6	1963555	1963560	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3587	NC_013851	CA	3	6	1963588	1963593	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3588	NC_013851	CGACC	2	10	1963606	1963615	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
3589	NC_013851	CTG	2	6	1963727	1963732	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3590	NC_013851	CGCC	2	8	1963749	1963756	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
3591	NC_013851	GC	3	6	1963954	1963959	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3592	NC_013851	CAA	2	6	1963972	1963977	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3593	NC_013851	CGA	2	6	1964010	1964015	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3594	NC_013851	GCTG	2	8	1964068	1964075	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
3595	NC_013851	TGG	2	6	1964082	1964087	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3596	NC_013851	CCG	2	6	1964095	1964100	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3597	NC_013851	CGG	2	6	1964519	1964524	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3598	NC_013851	GCT	2	6	1964528	1964533	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3599	NC_013851	GGC	2	6	1964538	1964543	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3600	NC_013851	CTTGAC	2	12	1964580	1964591	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
3601	NC_013851	CGG	2	6	1964667	1964672	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3602	NC_013851	TGC	2	6	1964729	1964734	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3603	NC_013851	ACA	2	6	1964745	1964750	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3604	NC_013851	TTC	2	6	1964785	1964790	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3605	NC_013851	CCTG	2	8	1964792	1964799	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
3606	NC_013851	GGA	2	6	1964809	1964814	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3607	NC_013851	CGG	2	6	1964825	1964830	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3608	NC_013851	GGC	2	6	1964877	1964882	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3609	NC_013851	CGGG	2	8	1964922	1964929	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
3610	NC_013851	CGGACG	2	12	1964936	1964947	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
3611	NC_013851	TGC	2	6	1964965	1964970	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3612	NC_013851	ACGC	2	8	1965056	1965063	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
3613	NC_013851	CCG	3	9	1965072	1965080	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3614	NC_013851	CCG	2	6	1965137	1965142	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3615	NC_013851	AGG	2	6	1966745	1966750	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3616	NC_013851	CG	3	6	1967186	1967191	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3617	NC_013851	TGTTT	2	10	1967248	1967257	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
3618	NC_013851	CGGA	2	8	1967266	1967273	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3619	NC_013851	CGA	2	6	1967281	1967286	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3622	NC_013851	GAA	2	6	1967428	1967433	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3623	NC_013851	CTTG	2	8	1967441	1967448	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
3624	NC_013851	ATG	2	6	1967460	1967465	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3625	NC_013851	GGA	2	6	1967552	1967557	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3626	NC_013851	CCG	2	6	1971011	1971016	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3627	NC_013851	CTG	2	6	1973010	1973015	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3628	NC_013851	T	6	6	1973909	1973914	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3630	NC_013851	GGCG	2	8	1975770	1975777	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
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